Por Gema Puerto
21 de septiembre de 2022Durante la pandemia, Andalucía ha analizado, controlado y monitorizado en tiempo real las características del virus Covid y su incidencia en la comunidad gracias a la secuenciación genómica (una tecnología que permite conocer y descifrar el código genético que han tenido los andaluces infectados). Se trata de una red colaborativa estructurada que ha estudiado cómo se ha transmitido el coronavirus en Andalucía desde los inicios, cuáles han sido las zonas con un mayor índice de contagio y cómo han influido las medidas sanitarias que se han ido implantado, entre otros aspectos.
Esta red colaborativa, única en el país, ha sido destacada por varias revistas científicas como una iniciativa eficaz en el abordaje, no solo de la pandemia, sino ante futuras pandemias y alertas de salud pública en enfermedades infecciosas.
Puesto en marcha por la Dirección General de Salud Pública y Ordenación Farmacéutica, con el soporte del Servicio Andaluz de Salud, este circuito ha permitido identificar y analizar las muestras, tomadas directamente de los pacientes infectados, detectándose la presencia de las variantes más comunes (alfa, beta, delta, ómicron, etc.) y de 193 de sus linajes y sublinajes a lo largo de toda la pandemia, conteniendo así un registro epidemiológico extremadamente detallado que da cuenta del paso del virus por Andalucía.
Esta iniciativa se enmarca en la integración de la secuenciación genómica del SARS-CoV-2 en las tareas de vigilancia realizadas por el Sistema de Vigilancia Epidemiológica de Andalucía.
Además, gracias a la secuenciación genómica, se puede realizar un estudio de las mutaciones que experimenta a lo largo del tiempo, sus características y sus posibles relaciones con variantes de otros países o localidades, lo que facilita detectar las introducciones de virus y las cadenas de transmisión. Los resultados de la progresión de este trabajo están disponibles públicamente en la página de la Fundación Progreso y Salud.
La utilidad de este circuito también se ha puesto de relieve en otra publicación científica que ha visto la luz recientemente en la revista Viruses. En este artículo, se presenta un estudio único en su género, donde los datos genómicos de las muestras analizadas junto a los datos clínicos de la Base Poblacional de Salud permiten obtener valiosa información como qué linajes son más patogénicos.
Centros que conforman el circuito
La secuenciación de los genomas de los virus está centralizada en los dos
hospitales de referencia designados para ello; concretamente, en el Servicio de
Microbiología del Hospital Universitario Virgen del Rocío de Sevilla,
y el Servicio de Microbiología del Hospital Universitario Clínico San
Cecilio de Granada.
Desde que se puso en marcha el circuito, se han secuenciado 30.000 muestras.
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